福建省建成小水電站6608處，裝機容量734萬千瓦，在全國位居第三，年發電量約243億千瓦時，占全省水電發電量的63%，占全省電力年發電量的13%。小水電固定資產417億元，從業人員逾10萬人，年發電收入90多億元，上繳稅金10多億元。

但福建小水電經過多年發展，目前存在一些問題：電站開發早，安全有隱患;電站裝機小，用水有矛盾;開發程度高，生態有影響。

為了全面統籌資源、環境、社會協調發展，為了注重統籌綜合效益，福建省將水電站增效擴容改造和整合退出同步推進，建立和完善水電站轉型升級機制和政策，通過提升一批、整合一批、限制一批和退出一批等方式，將小水電項目改造成安全可靠、保護生態、農民受益、良性運行的美麗電站。

“十三五”期間，福建將為每座電站量體裁衣，500座小水電站將進行生態化改造，到2030年，所有造成嚴重減脫水的電站，將全部落實生態流量。