目前，小水電綠色化改造是一個大方向，但是由于小水電改造技術、資金方面還是有困難，有必要采取措施激勵小水電向綠色發展。

國際上具有代表性的是瑞士的綠色水電認證和美國的低影響水電認證。瑞士聯邦環境科學技術研究院(EAWAG)通過多年的案例研究和實踐，于2001年提出了綠色水電認證的技術框架，建立了綠色水電認證的標準。滿足水文特征、河流系統連通性、泥沙與河流形態景觀與生境、生物群落5個目標，且有生態修復措施的水電站，每度電上可以加一定的價格進行銷售，且該筆收入用于生態修復。

美國低影響水電研究所(LIHI)則提出低影響水電認證,通過識別，對采取措施將其對環境的影響降至最低程度的水電站大壩進行獎勵，使其在市場上能夠以“低影響水電”的標志進行營銷，從而通過市場激勵機制來鼓勵業主采取有效措施減少水電站大壩對生態與環境的不利影啊.

其實，在2011年，環保部(現為生態環境部)本擬召開的綠色水電認證課題研討會，因經費問題而延后,一年后會議在貴陽召開時，受邀參加的國家能源局因故未能與會。

而彼時，走“綠色水電”還是“低影響水電”存在爭議。當時有水利專家向媒體透露，“低影響水電”側重法律手續的完備，而綠色水電則側重考量技術指標。當“綠色水電還在研討階段，五大發電集團就傳出了反對聲音。”

而后，水利部推出了“綠色小水電”方案，進行小范圍試點。2016年初，中央一號文件提出“發展綠色小水電”。同年12月，水利部發布《關于推進綠色小水電發展的指導意見》，旨在推進綠色小水電的發展，并計劃到2020年建立綠色小水電標準體系和管理制度，初步形成綠色小水電發展的激勵政策，創建一批綠色小水電示范電站。到2030年，全行業形成綠色發展格局。

不過水利部公布的數據顯示,2017年，全國僅有44座電站申報，占小水電站總數的千分之一，且申報的幾乎都是國有電站。原因在于，有的小水電因為建設時間久、設施陳舊、效益低下，受到技術條作的限制，而配套激勵措施缺失使得小水電業主積極性偏低。

我國也有省份給予小水電激勵措施以促進小水電改造。例如淅江省金華市于2017年建立了市本級4座水庫生態放水及放水后發電損益補償機制，探索綠色小水電發展的生態補償機制，合理補償以生態環境保護為目的進行季節性限制運行的小水電站的發電損失。

福建也有自己的辦法。2017年12月11日，福建省物價局、經信委、環保廳、水利廳四部門聯合下發了《福建省水電站生態電價管理辦法》，對監管范圍內的水電站實施分類生態激勵電價機制，對落實生態流量、改善河流水環境的小水電站實行電價獎勵，反之則降低其上網電價以示怎罰。

有業內人士表小，該改可以整改，但是怎么改、改到什么程度需要指導，此外小水電效益不高，經濟上也希望能夠得到支持。“要改、怎么整改，我們會根據指導和要求去做，而不是就這么炸掉。”王營修有些不能理解，現在他只能到處打工。

在生態文明大環境下，對小水電的要求越來越高。劉樹坤對此表示認同，他還提醒，下一步，是否會涉及對生態影響較大的中型水電站還有待關注。